全てのキノピオの居場所をまとめています。キノピオを救出するとキノピオポイントが増えます。キノピオポイントは博物館のアート開放に使えます。
ストーリーを進めないと救出率が100%にならないコースもあります。
「キノピチュいせき」などストーリーで必ず救出するものは省略しています。ストーリーの攻略はこちらにあります。
追記 2020-07-18
全て埋まりました。お宝フィギュアの場所はこちらにまとめています。
https://hyperts.net/papermario-figure/
追記 2020-08-06
キノピサンドリアのプールのサーフボードになっているキノピオを叩けなくなる不具合はアップデートVer1.0.1で修正されました。
デクの山
テントの少し先にあるブランコに止まっているセミ、ハンマーで叩く
テントの中
キャンプ場の薪の後ろにある木を叩くとセミが落ちてくるので叩く
キャンプ場にいるキノピオを引っ張り出す
キャンプ場右下の葉っぱに埋もれている
キャンプ場のログハウスの左、塀の奥側
キャンプ場のログハウス手前にある薪に挟まっているので引っ張る
キャンプ場にある4つの植木鉢をジャンプで叩く、花が咲くのでハンマーで叩く
キャンプ場の東屋（屋根だけの場所）のベンチの下敷きになっているので引っ張る
キャンプ場の東屋の机の上にあるお皿を叩く 
海図3C右にいるヘイホーの前で潜って大きな貝を手に入れてバーベキューで焼く
ラクガキすいろ
キノピオタウン
ストーリー進行（画像なし）
ピクニックロード
キノピオタウンから出てすぐ左の葉っぱに埋もれている
キノピオタウンから出て少し進んで左にある柵の内側x4 
柵があった場所より少し奥にある小さい穴をハンマーで叩く 
中央にある看板から左、壁の近くに咲いている黄色い花を叩く 
黄色い花の奥側に折られたキノピオがいる 
研究所のポストを叩くと出てくるx3 
ゴルフ場の右にある木を叩く
ゴルフ場のバンカーに埋まっているので引っ張る
ゴルフ場の旗のすぐ左を叩くと階段ブロックが現れるので上って旗に飛びつくx7
ゴルフ場の旗をハンマーで叩く 
一番奥にいる犬を叩く 
ゴルフ場左の川の側にいるチョウチョを叩く 
研究所の左手前にいる青いチョウチョを叩く
中央の池にあるハテナブロックをハンマーで叩いて進んでアヒルを叩く 
土神様の扉がある場所の右の壁をハンマーで叩くと魔法陣が現れるx10 
占い屋の受付にいるキノピオ 
占い屋の前にあるパラソルを叩いて足場を作って横穴にいるキノピオを叩く 
占い屋側にあるポップコーンマシーンを使うx4 
土神寺院の向かい側を降りた先、横穴を右に進むとネズミがいるところ 
土神寺院の前にある屋台にあるキノコの折り紙、叩くのが少し難しい 
コース中央の看板を叩くと出てくる 
研究所の右手前にある木を叩くと出てくる 
ミハラシ山に続く道の近く、右の壁にある穴を叩くx4 
センサー研究所の看板を叩くと出てくる 
センサー研究所の黄色のボタン
センサー研究所のテストx6
ゴルフ場の少し下にいる黄色いチョウチョ
占い屋の後ろの穴の中 
中央の看板から左下、左の壁に穴が空いている付近にいる紫のチョウチョ 
ゴルフ場の右の木から少し上の地面にある穴を叩くと出てくるムシ 
ゴルフ場の旗から左下にある花、穴が空いているので叩くと出てくるチューリップ 
中央の看板から左下、左の壁に穴が空いているので叩く 
ゴルフ場の右にある草の柵の向こう側、上に木があるところから降りれば入れる 
土ガミじいん
2つ目の賽銭箱を叩くと出てくるムシ
3つ目の賽銭箱を叩く 
5つ目の賽銭箱の近くにある岩を壊すと出てくるx3 
5つ目の賽銭箱手前の階段を照らすランプをジャンプで揺らす 
土上様のお顔の真下、崩れる壁がある場所でバサバサに襲われている 
ミハラシ山
ピクニックロードから出てすぐの看板を叩く
ピクニックロードから出てすぐ左奥、宝箱の近く 
旅の土管の近くにある石を叩いて壊す
白い橋を渡ってすぐ左の崖、壁に張り付いている 
白い橋の先にあるセーブから手前側、埋まっているキノピオx5 
ドッスンが落ちてきた坂にある柵の左側手前にいる 
頂上から左の坂を降りた先でサッカーボールにされている 
頂上から左の坂を手前側に降りた草むらにいるバッタ 
ロープウェイ乗り場の看板左にある階段の奥側、さらに左に進む道があるx10 
頂上から左の坂を降りて手前側、柵のないところを落ちた先のハテナブロック 
頂上から左に進んだ先で三角パスをしているハリボテ兵を倒す 
右の茂みにいるバッタx3
バッタが3匹いた茂みにいるムシ 
旅の土管の後ろの木にいる、オリガミ兵に襲われているところを助ける 
釣りで釣れた青い魚 
頂上にある看板を叩くと出てくる 
コース右下にある東屋の屋根の上を渡った先 
旅の土管の左上、草むらの奥に道がある 
ロープウェイにある鉢植えをジャンプで叩く
ミハラシタワー
入ってすぐ左にある手紙
入ってすぐ右の棚x3 
1階エレベーターのドアに挟まっている 
入って右にあるゴミ箱x3 
1階エレベーター右の壁にあるペナント、棚に上って叩く 
2階左の部屋の棚の上にあるシールを剥がす 
レストランの一番右にある食器棚の中 
厨房の棚の中 
厨房の棚の上の折り紙 
厨房の右の棚のバケツの中 
厨房の真ん中にあるゴミ箱の中 
厨房の目玉焼き 
4階のエレベーターに突き刺さっている青色鉛筆 
屋上の右にある双眼鏡を叩く 
モミジ山
ロープウェイ乗り場にいる
ロープウェイ乗り場の前にいる青いサカナ 
ロープウェイ乗り場の右奥のコインがあった場所の落ち葉に埋もれている 
川下り屋の看板横にある缶詰の中 
ススキーノ大草原に入ってすぐ左、柵の左側の中央辺り 
ススキーノ大草原の一番左下、下に落ちる穴がある 
ススキーノ大草原の中央下、坂道がある場所の近く 
水ガミ神殿前の橋を渡った先にある2つ目の木を叩くと落ちてくる 
センサー研究所の紙詰まり 
水ガミ神殿右の高台にある木を叩くと落ちてくる 
水ガミ神殿右の高台にある土管を使った先にいるトンボ 
水ガミ神殿右の高台にある土管を使った先にいるムシ、魔法陣を使って叩く 
ススキーノ大草原の出口から少し左下に進んだところ 
水ガミ神殿左の壁のテープを剥がす 
水ガミ神殿前、橋と橋の間に飛び出てくるサカナ 
池の左手前のボートが積まれているところにいるムシ 
池の左手前の木箱の上の黄色いモミジ 
池の一番左の木を叩くと落ちてくるx3 
ロープウェイ乗り場の右奥、柱の近くにある赤い落ち葉 
イガグリ谷
イガグリが落ちてくる木を叩くx3
イガグリがたくさん並んでいる場所の一番上側にある穴を叩く
出口手前の切り株の近くに飛んでいるチョウチョ
セーブポイントの手前側にある木を叩くx3 
水ガミしんでん
入ってすぐ左の壁にいるムシ
最初の部屋の下層、壁の穴に詰まっている 
水車が2つある部屋の右下にある横穴を進んだ先 
OEDOランド
入り口前のハートの折り紙
入って2つ目の左側にある家のうちわ 
十字路左の壁に挟まっている 
十字路を左、1つ目の家の花 
十字路を左、2つ目の家のタンスの中 
十字路を左、3つ目の家の紫の座布団を叩く 
十字路を右、灯籠に挟まっているので叩く 
お団子屋の近くにいる黄色い犬 
お団子屋の前にある傘を叩いて開く 
お団子屋の左の座布団 
シュリケン道場の的に刺さっている手裏剣 
お城の前のカンバンに張り付いている 
長屋の一番左の家の花、下に隠しブロックがあるので乗ってジャンプ 
長屋の一番右の家のツボの中x4 
長屋の真ん中の家の青い魚 
十字路を真っ直ぐ進んで右の家のミノを叩く 
お城の前の道を左に進んだ先の家の灯籠x4 
なりきり写真館の左の壁にある写真 
なりきり写真館の看板、屋根の上を渡って叩く 
お城の前の道を右に進んだ先にいるトンボ 
スタッフルームの前のトンボ 
お城の右の池がある場所、上の灯籠を叩くと魔法陣が出てくるので使う 
お城の右の池がある場所、左にある箱を上って印のついていない提灯を叩く 
お城の右の池がある場所、右下の家の囲炉裏を叩くx3 
スタッフルーム入って左の棚の上 
スタッフルーム入って右のハリボテに挟まっている 
スタッフルームのロッカー 
ワンワンの小屋にいるムシ 
センサー研究所の紙詰まり 
お土産屋の二階のふすまの裏 
写真館の左の家のミノ 
釣りで釣れた青い魚 
ヤグラの鐘を30回叩く
にんじゃやしき
忍者屋敷の左の石から屋根に上ってテープを剥がす
忍者屋敷前の岩を壊す 
忍者屋敷中庭の石灯篭を叩いてスタッフルームに入る、箱に挟まっている 
忍者屋敷中庭の石灯篭を叩いてスタッフルームに入る、ロッカーの中 
OEDO大げきじょう
ステージ右袖にいる
プリンセスピーチ号
エントランスホール左下にいる
ラウンジの棚にある紫の瓶 
機関室右下の木箱 
VIPルーム手前のフロアの左下 
機関室の階段上の手すりに抜けられる隙間があるのでそこから発電機の後ろ側に降りた先 
かぜぬけるトンネル
ブーツカーの下敷きになっている
出口付近にあるスコップ 
ヤケスナ大さばく
中央一番左の斜面にいるトカゲ、上からブーツカーで落とす
センサー研究所の紙詰まり 
中央やや上の地面に埋もれている 
右下の地面に埋もれている 
右下のレンガがある場所のサソリ 
レンガ地帯の一番右にある横穴を進んだ先にあるサボテン 
右上の祭壇から少し下の地面に埋もれている 
塔の左側面にいるムシ 
ヤケスナさばく
左にあるサボテン
右にある小さなサボテン
ヒダリさばく
中央右上にある小さいサボテン
左下にあるサボテン 
塔の右にあるサボテンの周りに埋もれているx3
塔の右にあるサボテンについているドクロ 
ミギさばく
左下にあるサボテンを壊すと地面に埋もれている
右下にあるツボから出てくるヘビx4 
ヒダリオクさばく
左下にある岩を壊すと地面に埋もれている
ミギオクさばく
右上にある岩を壊す
左下の地面に潜るサソリx2
キノピサンドリア
ベンチの少し左上にある木箱を破壊した壁の穴
オアシスの上の方にある箱の上の黄色いチューリップ 
ショップの1つ上の看板 
DJショップの右の壁 
ロイヤルホテル内右下の木箱に挟まっている 
ロイヤルホテルの一番右の部屋の前にある花瓶 
ロイヤルホテルフロントの右下にある台車を左から叩く 
セーブポイントの左の家の裏側にある階段を上がる（草むらの奥）金色の柱を叩く 
セーブポイントの左の家の裏側にある階段を上がって左のシーソーにジャンプ 
ランプの露店の中から右に出て上った先にある箱を壊す 
壊れている階段がある場所の左のヤシの木を叩く、ベンチから左上に進んだところにある2段の小さい木箱の横に隠しブロックがあるのでハンマーで叩く 
ロイヤルホテルの看板を照らしている左手前のライト、塀の上から叩く 
ロイヤルホテルのDJブースに上って左の柵をを超える、木箱のネズミを倒して魔法陣を使うとサーフボードの叩ける 
左下のカフェの前（黄カミテープ破壊後）x10 
ドクロ島
海図G5にあるドクロ島のドクロの左耳からさらに左に進んだところ
キノコ島
海図E4にあるキノコ島の右にいる青い魚
家の裏側左にいる青い魚
ハンマー島
海図A4にあるハンマー島の中央の穴を叩いて引っ張り出す（画像なし）
ハテナ島
海図B5にあるハテナ島の頂上にある看板
ミカヅキ島
中央右にいるウサギ
釣りで釣れた青い魚 
中央左に現れる赤い魚
ハート島
草むらをハンマーで叩くとスイッチが現れるので仕掛けを解いて中央のハート
右上の宝箱の中 
スペード島
左にある樽の上の隠しブロック
右にある樽を壊す 
左上のヤシの木を叩く 
右下のイスの背もたれ部分を叩く 
キノピオを全て刺す 
クラブ島
島に上がってすぐ
草むらの左 
草むらの左下 
草むらの右上 
てんくうスパーランド
清めの湯の建物の奥側にあるセンサー研究所の紙詰まり
ミギさばくのサボテン（画像二つ）はヒダリさばくのものでした